基于高通量测序分析储藏稻谷中的真菌群落结构与优势菌属

来源 :食品科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nyjnju
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探究不同环境条件下储藏稻谷中真菌多样性与真菌群落结构的变化.方法:以湖南衡阳仓储稻谷为研究对象,在不同温度(10、20、25、30、40℃)和环境相对湿度(43%、75%和85%)条件下进行模拟储藏,然后利用Illumina HiSeq高通量测序技术分析原始稻谷与不同储藏条件下稻谷中真菌菌群结构与优势菌属.结果:基于可操作分类单元的物种分类分析,原始稻谷及在不同温度、湿度条件储藏后稻谷中的真菌群落共计属于6个门、24个纲、67个目、160个科、285个属、406个种.从门水平看,原始稻谷与储藏后的稻谷中子囊菌门(Ascomycetes)为优势菌门,相对丰度为2.53%~96.86%;其次为担子菌门(Basidiomycetes),相对丰度为0.02%~9.39%.从属水平上看,稻谷中的优势菌属有白僵菌属(Beauveria)、Ophiosphaerella、曲霉属(Aspergillus)、赤霉属(Gibberella)、链格孢属(Alternaria)、暗球腔菌属(Phaeosphaeria)、黑孢属(Nigrospora)、微座孢属(Microdochium)和假丝酵母属(Candida).从种水平上看,优势的菌种为球孢白僵菌(B.bassiana)、O.agrostidis、黄曲霉(A.flavus)、黑曲霉(A.niger)、赭曲霉(A.ochraceus)、错综赤霉(G.intricans)、链格孢霉(A.longissimi)、小孢暗球腔菌(P.microscopica)、黑孢霉(N.oryzae).通过Venn分析与主成分分析,发现原始稻谷样品与不同温、湿度条件下储藏后的稻谷样品中真菌群落多样性存在较大差异,不同温、湿度条件中的稻谷样品真菌群落多样性之间也存在差异.结论:相对湿度是影响A.flavus相对丰度的最重要因素,当相对湿度为85%时,A.flavus相对丰度在各储藏条件中达到最大.综上所述,本研究对仓储稻谷的安全储存条件的优化提供了理论支撑.
其他文献
种群动力学是生物数学研究的重要方向之一.近年来,学者们从不同的角度出发建立了纷繁的生态数学模型来描述种群之间的数量演变关系,并对建立的动力学模型进行了大量理论研究,取得了丰硕的成果.本文基于常微分方程的稳定性理论,规范型方法和中心流形定理分别研究了具扩散的时滞捕食-食饵系统和具线性收获项的时滞偏利合作系统的动力学行为,包括正解的稳定性、Hopf分支存在性、Hopf分支方向及周期解稳定性、Turin
溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)是一类发生在结肠和直肠的非特异性炎症性疾病,表现为腹痛、腹泻和血便,易反复发作,难以完全治愈。目前,UC的病因尚不明确,但已知的是过度活化的促炎性细胞及其分泌的细胞因子能够引起UC的发生发展,且抑制过度活化的促炎性细胞,或增加具有抑炎作用的调节性T细胞(Regulatory T cell,Treg)有利于改善UC。白细胞介素35(Inter
近些年来,双酚A广泛应用在高分子材料、精细化工产品以及日常生活中,由于其迁移出的污染物可以进入人体,对人体造成伤害,且目前双酚A痕量检测还不是很完善,所以检测痕量的双酚A也成为一项有意义的工作。传统的荧光光谱法、高效液相色谱法、酶联免疫吸附实验分析法等由于其劣势已经渐渐不予满足特异、快速检测的要求,故电化学生物传感器检测双酚A已经成为了主要的检测方式。本实验中研究了材料的合成方式与过程、微观的形态
以不同生产阶段的贵州水豆豉为研究对象,利用Illumina MiSeq高通量测序技术,对贵州水豆豉自然发酵前后、调味后发酵3个阶段的细菌菌群结构及多样性进行研究,并对其优势菌进行分离鉴定.结果 表明,3个样品共得到296063条有效数据,1124个操作分类单元.在3个样品中共注释了6个门类,21个属类.在门水平上,随着发酵时间的延长,厚壁菌门(Firmicutes)丰度不断增加,变形菌门(Proteobacteria)不断减少.在属水平上,随着发酵时间的延长,芽孢杆菌属(Bacillus)丰度不断增加.后
以金针菇膳食纤维(dietary fiber,DF)为原料(其中可溶性膳食纤维(soluble dietary fiber,SDF)质量分数8.2%),分别采用纤维素酶法和高温蒸煮法对其进行改性处理,在单因素试验基础上通过正交优化试验得到改性最佳工艺优化参数.纤维素酶法处理最佳工艺为液料比35∶1、纤维素酶用量1.5%(以体系质量计)、酶解时间2h,在此工艺下SDF得率为16.2%.高温蒸煮法处理最佳工艺为液料比30∶1、蒸煮温度125℃、蒸煮时间50 min,在此工艺下SDF得率为20.4%.将以上两种
通过添加果胶或果胶酶调节重组苹果块中果胶含量,探讨果胶对真空冷冻干燥重组苹果块的硬度、脆度、孔隙特征和吸湿动力学等核心品质的影响.结果 表明,与对照组相比,当果胶添加量为0.5%~4%时,果块出现了典型的蜂窝状多孔结构,硬度提高到2.01~5.41倍,脆度增加到1.17~1.27倍,振荡破损率下降38.97%~55.78%;与此相反的是,经果胶酶处理的果块呈现杂乱的大孔隙结构,其硬度下降34.03%,脆度增加到1.13倍,振荡破损率增加到1.24倍.此外,添加果胶的果块吸湿性显著下降,相对湿度在70%~9
夏南牛是我国自主培育的第一个专用肉牛新品种,为促进夏南牛肉及其深加工产品的工业化和科学化发展,本实验研究不同部位牛肉的理化指标和加工品质指标的差异,并评价其牛肉干加工适宜性.选取并测定20个原料肉理化指标和9个牛肉干产品加工品质指标,利用相关性分析和主成分分析筛选关键指标,并建立评估方程.结果 表明:不同部位牛肉理化特性存在明显差异.臀肉的水分质量分数(75.47%)和蛋白质量分数(21.51%)最高,脂肪质量分数(2.39%)最低(P<0.05),凝胶和乳化性能较好.肩肉的脂肪质量分数最高(8.69%)
从单克隆杂交瘤细胞出发,构建抗3-氨基-2-噁唑烷酮(3-amino-2-oxazolidinone,AOZ)衍生物单链抗体基因,并对其蛋白质进行理化性质分析及结构预测和活性鉴定.首先以呋喃唑酮代谢物AOZ衍生物单克隆抗体杂交瘤细胞1D2为原料,提取总RNA后克隆重链(VH)、轻链(VL)可变区基因,然后使用重叠延伸聚合酶链式反应技术用连接肽(G4S)3将VH、VL基因连接构建抗AOZ衍生物单链抗体基因,经测序后采用生物信息软件对抗体编码的氨基酸序列进行推导并展开生物信息学分析,再将此基因与Plip6/G
分离筛选高产转糖基活性β-半乳糖苷酶的乳源微生物,为高效合成低聚半乳糖(galacto-oligosaccharides,GOS)提供新酶源.以添加5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-Gal)的乳糖为碳源的乳酸细菌培养基(MRS)进行初级分离筛选,以产酶菌株粗酶液催化乳糖转糖基反应产物的薄层层析进行复筛,单因素优化最佳产酶条件和转糖基反应条件,硫酸铵分级沉淀纯化β-半乳糖苷酶并对其酶学特性进行初步分析.筛选获得产转糖基活性β-半乳糖苷酶乳酸菌20株,选择产酶水平较高、转糖基活性最强的产β-半乳
为探索西式发酵火腿低钠加工过程中细菌群落结构变化差异,采用Illumina MiSeq测序技术对细菌16S rRNA V3~V4高变区进行测序.分类学分析结果表明,所有样品中细菌群落可分为31门664属,厚壁菌门(Firmicutes)是低钠组第一优势菌门,葡萄球菌属(Staphylococcus)是低钠组第一优势菌属.结合理化性质分析结果表明,食盐含量、水分含量以及pH值均对西式发酵火腿细菌群落结构具有显著影响.根据京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and