【摘 要】
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以鲜切马蹄为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆马蹄CHS基因全长序列,并对该基因进行生物信息学分析及表达分析,以期为该基因的功能研究提供参考依据。结果表明:在马蹄中克隆到C
【机 构】
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贺州学院食品科学与工程技术研究院; 广西果蔬保鲜和深加工人才小高地;
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(31801607);广西自治区自然科学基金资助项目(2017GXNSFAA198082,2015GXNSFBA139082);广西特聘专家专项经费资助项目(厅发[2016]21号)
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以鲜切马蹄为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆马蹄CHS基因全长序列,并对该基因进行生物信息学分析及表达分析,以期为该基因的功能研究提供参考依据。结果表明:在马蹄中克隆到CHS全长cDNA序列,基因命名为CwCHS。CwCHS基因全长1 519bp,编码394个氨基酸。CwCHS蛋白分子式为C1 927H3 072N526O568S21,分子量为43.37kDa。该蛋白质包含3个保守结构域,含有5个酪蛋白激酶Ⅱ识别位点、1个蛋白激酶C识别位点、6个N-豆蔻酰化位点和1个糖基化位点,其二级结构以α-螺旋为主。多重比对结果表明,CwCHS具有高度保守的酶活性位点,并与其它植物的CHS蛋白有很高的同源性。系统进化分析表明CwCHS与菠萝CHS蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR分析结果表明鲜切马蹄贮藏过程中CwCHS表达量快速上升,水杨酸处理显著抑制了CwCHS的表达。试验发现,CwCHS的表达水平与鲜切马蹄黄化关系密切。
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