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发育轴突向正确的靶位生长是建立精确神经环路的基础。海马内主要的传入通路是内嗅皮层-海马通路,兴奋性合缝,联合系统中隔投射,它们以层状形式终止于齿回与Ammon角的靶神经元。在海马内部,齿回与CA3区的苔藓纤维,CA3区与CA1之间均建立了特异的纤维联接系统。细胞培养测定和包括基因敲除在内的分子生物学策略研究表明,在发育过程中复杂的导向信号网络对海马内联系的形成有重要调节作用。分泌性Ⅲ型semaphorins,netrin 1和Slit蛋白及局部膜或基底锚分子如ephrin A亚家族配体,共同介导了海马内联