大花序桉EST-SSR标记开发及其种间通用性评价

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:snowin11
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大花序桉(Eucalyptus cloeziana)为中国重要的珍贵用材树种,其基因组序列信息及可用分子标记的缺乏,影响了大花序桉的分子育种研究。本研究旨在开发大花序桉EST-SSR多态性标记,并评估它们的遗传多样性检测水平和种间通用性。根据大花序桉转录组测序数据设计开发EST-SSR引物,基于两个大花序桉群体(n = 82)和其他8种桉树进行进一步评估。结果表明:所设计的150对EST-SSR引物中,114对成功扩增出目的条带,89个在6个大花序桉样本中呈现多态性。随机挑选30对多态性EST-SSR引物扩增82份大花序桉样本,平均等位基因数(Na)和多态性信息含量(PIC)分别为7.97和0.771。这些标记至少能成功扩增8种参试桉树中的一种,在细叶桉(97%)、赤桉(90%)和尾叶桉(90%)中观察到了较高的通用率,其次是巨桉(83%)和窿缘桉(80%),而在粗皮桉(50%)、柠檬桉(47%)和大叶桉(27%)中观察到较低的通用性。根据30个EST-SSR位点在不同桉树中的扩增能力和多态性,采用UPGMA对参试桉树构建系统进化树,与前人对部分桉属树种的系统进化关系较为一致,大花序桉亚属(Idiogenes)的大花序桉与细叶桉和赤桉聚为一类,其他桉树聚为一类。意味着这30个多态性EST-SSR标记信息丰富,能够揭示9种桉树种间的亲缘关系,可以为大花序桉及其桉树近缘种的种间杂交和分子育种提供参考。
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