小鼠烧伤后时序芯片数据分析及免疫标志物的初步筛选

来源 :暨南大学学报(自然科学与医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:hheeuuuu
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目的:从基因转录水平探讨烧伤早期免疫系统功能变化情况,并筛选烧伤后免疫相关标志物,为临床诊疗提供新思路.方法:GEO 数据库下载 GSE7404数据集(小鼠,25%TBSA,3度),共获得32例基因表达谱数据.应用配对样本 t 检验和倍比法(fold-change,FC)筛选差异表达基因(P-value <0.01和|lgFC |>1).分别利用 DAVID数据库和 STRING 数据库进行生物学过程功能富集分析及构建免疫相关蛋白互作网络.互作网络的模块及可视化分析应用 Cytoscape 软件进行,并用
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