内皮祖细胞外泌体中与血管生成相关的miRNAs生物信息学分析

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目的

用生物信息学方法筛选内皮祖细胞(EPCs)外泌体miRNA用于调节血管生成的医学科学研究。

方法

从现有数据库中筛选人内皮祖细胞外泌体miRNAs,同时筛选与血管生成相关miRNAs,取两组miRNAs的交集,从而获得内皮祖细胞外泌体中与血管生成相关的候选miRNAs分子。

结果

通过实验数据分析和文献筛选获得的内皮祖细胞外泌体miRNAs分别为160个和50个,与血管生成相关miRNAs分子约600个;分别取频次较高的前20个,最终获得9个在内皮祖细胞外泌体中可能高表达且与血管生成相关的miRNAs:miR-126、miR-21、miR-221、miR-92a、miR-199a、miR-210、miR-214、miR-155、miR-146a。

结论

基于数据分析和文献筛选的生物信息学可简单而可靠地筛选目标miRNA进行后续研究,有较高推广应用价值。

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