杭州市水痘-带状疱疹病毒流行株基因型特征分析

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目的 了解杭州市水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型别特征.方法 采集2012-2017年临床诊断水痘患者疱疹液,提取样本DNA,PCR扩增ORF 22、38、54、62基因片段.用单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)方法分析ORF 22基因片段,确定病毒基因型别;用限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)技术分析ORF 38、54、62基因片段,区分野毒株和疫苗株.结果 23例临床诊断水痘患者的疱疹液中21例样本VZV核酸阳性.SNP分析结果显示,21例阳性VZV的基因型均属于clade 2.RFLP分析结果显示,21例阳性VZV均为野毒株(PstI+ BglI+ SmaI-).结论 杭州市VZV流行株基因型别主要是clade 2,未发现疫苗株感染.
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