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用腮腺炎病毒小疏水蛋白（SH）基因及其旁侧区的逆转录（RT）套式聚合酶链反应（N-PCR）产物进行银染单链构象多态性（SSCP）分析，建立了较适的样品变性和聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）条件。根据单链电泳模式可将所测6株腮腺炎病毒分为四种SSCP模式，3株兰州野毒株Wlz1，Wlz2，Wlz3呈现一种模式，这3株病毒的SH基因及其旁侧区cDNA序列之间平均差异仅为0.96%；两株上海野毒株Wshl和Wsh2株的相应序列之间差异为4%，呈现另两种模式。Enders株呈现一种与野毒株差别较大的特殊模式。3株兰州野毒与2株上海野毒相应区域序列之间差异为3.4%～4.5%，故本法可区别SH基因及其旁侧区cDNA序列之间差异为3.4%的野毒株，且SSCP模式的相近程度与相应区域中核苷酸序列同源性大小一致。此法可用于腮腺炎病毒株分子特性和遣传变异的初步鉴定和分子流行病学研究。