蓖麻蚕rDNA5’-非转录间隔区的DNA序列及结构特征

来源 :生物化学与生物物理学报 | 被引量 : 2次 | 上传用户:dalianmaowh
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我们测定了蓖麻蚕rDNA5'-非转录间隔区SacII-EcoRI片段的DNA序列,它的长度为1025bp,A+T含量大于70%。本文报道该片段的序列特征,用计算机对其内所具有的结构基序(motifs)进行分析结果说明,其中包含多个与核骨架结合区(SAR)有关的结构基序和酵母自主复制序列的核心序列(ACS).包括9个弯曲DNA(bentDNA)、10个T盒、5个A盒结构基序以及13个拓扑异构酶II的识别位点的同源序列,34个反向重复序列,30多个ATTA/TAAT、ATTTA/TAAAT和ATATTT/AAATAT结构基序和15个ACS同配序列,其中有许多结构基序是相互重叠的.这些特殊结构在SAR区域的集中出现可能是多种蛋白质因子的识别和结合位点,与SAR参与基因表达、复制的调控有关。联系人。材料和方法1.1蓖麻蚕rDNA非转录间隔区的亚克隆将包含有蓖麻蚕rDNA非转录间隔区的亚克隆PARIV”’经Sacll和EcoRI双酶切,从低熔点胶中分离出约Ikb的片段,插入到经S。11和ECORI完全酶解的PSK和PKSktratagene)中。筛选得到的亚克隆再经Accl进一步亚克隆。所用限制酶和DNA连接酶购自B?
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