大石围天坑底部海拔900～1000米，从天坑四周俯瞰天坑底部森林，由于各处角度不同。所看到的底部森林形态也各异；一年四季的变化，天坑底部森林外貌也有不同的天然色彩。天坑底层植物终年生活在水雾弥漫、相对无风的环境中，相对湿度常保持在70％以上。天坑的植被遮天避日，密林中不时传来鸟儿的叫声。
　　
　　天坑底部
　　
　　天坑底部独特的小气候和地形环境，使这里的植物形成了自己独特的形态，这些植物一旦脱离天坑这个环境，可能就完全不是这个样子了。少有人涉足的天坑底部是非常典型的原始生态植物基因库。
　　林下的阴生草本植物几乎全部发育为阴生肉质草本形态，如狭叶巢蕨、深绿短肠蕨、马蓝花、火焰花、冷水花、楼梯草、雾水葛等，这些肉质植物本身也是阴湿环境的产物，又是维持这种特殊水热条件的必要物种。
　　通常天坑底部的湿度很大，到处都长满了各类苔藓和形态各异的蕨类，由于光照不足，这里的植物变得十分脆弱。比如神木天坑中的蕨类植物不仅叶面大，颜色深，而且与附近天坑生长的蕨类有明显的不同，纹路较深，属于比较原始的蕨类。
　　
　　优雅兰花
　　
　　兰花具有令人难以捉摸的幽香，它端庄秀丽的花容，素洁高雅的风姿，充分体现了东方特有的温馨和淡雅宜人的格韵；无花之时，兰花那刚柔相济、疏密有致的条形叶丛，临风摇曳，尽显风姿神韵，因此，古往今来它赢得了无数文人墨客的颂赞。
　　乐业是著名的兰花之乡，天坑中生长着许多种类的美丽兰花。围绕黄猄洞天坑的坑边常年盛开的野生兰花，密度大、品种多，而且有不少稀有，名贵的兰花种类，这使得黄猄洞天坑具有独一无二的尊贵价值。黄猄天坑国家森林公园也因此而成为全国惟一的以兰科植物命名的自然保护区。
　　我国野生兰科植物挣扎在灭绝的边缘，其中，石斛兰有纪录的74个种类，就有三十多个因药用而受到严重威胁，有的石斛兰已到极度濒危
　　难觅踪影的程度。但是黄猄洞天坑却是野生兰花眷恋的乐土，它们在这里自由生长。
　　根据专家考察，在黄猄洞天坑森林公园林区里，生长着40属110种原生状态的野生兰科植物。在海拔300米～1900米地区成片分布着珍稀的兰科植物，有铁皮石斛、多花兰、带叶兜兰、长瓣兜兰、硬叶兜兰、西藏虎头兰等。云南石仙桃、莎叶兰、兔耳兰等二三十种兰科植物也有密集分布。这里每4D0平方米就分布着20种～30种兰科植物，密度之高国内罕见。在这里专家们发现的孟兰属为广西新纪录，大根兰、报春石斛、密花毛兰、小花火烧兰，滇金石斛、红头金石斛、贵州地宝兰、长距玉凤花和，孟兰为广西新记录的品种。
　　
　　天坑森林的中上层
　　
　　天坑森林的中层也就是灌木层，主要生长着以棕竹为优势种群的美丽植物。大石围天坑森林中的棕竹，一般高度在5～6米，十分罕见。由于生长年代久远(100年以上)，因此树干基部“竹节”分外明显，节间黄绿光净，酷似竹子。成片分布的天然野生棕竹在我国森林中并不常见。
　　天坑森林的上层乔木，以香木莲为主。根据我们考察这种珍稀树种能正常开花结果，也产种子，但发芽率低，幼苗成活更为稀见，因此除了在大石围底部发现成片生长外，其他环境中几乎难寻踪影，足见其珍稀程度。大石围天坑底部香木莲般为成年大树，胸围两米左右，树高30米者不在少数。大石围天坑四周绝壁上，分布着针阔常绿落叶混交林植物群落，包括短叶黄杉
　　福建柏、细叶云南松、鹅耳枥、苦丁茶、青冈细叶青冈、酸枣等乔木树种和九里香、鼠剌，寒兰等灌木和草木植物。其中树形雄伟挺拔极具观赏价值种类首推短叶黄杉。这种“喜”生于天坑绝壁的松科植物，当地居民普遍称之为“天枕”，它们大多分布于大石围天坑，雀巢天坑、白洞天坑的绝壁顶部。鹅耳枥、是一种冬季落叶的著名硬材，在大石围南部凹口处，由于土层肥厚，排水良好，所以长势极佳。福建柏是柏树类的珍品，因其树皮肉红，树叶扁平，浓绿，叶背面常生有鲜亮的绿白色气孔带，是观赏柏科植物的著名代表。大石围植被中，有兰花、龙胆、远志等花果鲜艳的草本植物；八角莲、淫羊藿、鸡爪黄连、狭叶重楼等药用植物，都是非常实用的植物种类。