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文章首先综述新世纪国家高新区取得的新成就、新特点及增速回落的原因；接着，指出国家高新区在“二次创业”新阶段的主要任务是大力推进自主创新，把高新区建设成为国家创新体系的核心基地之一。国家高新区要努力实现“五个转变”，自主创新是高新区发展的必然阶段；高新区“二次创业”的核心任务是建立区域持续创新体系。