鞘翅目是世界上物种最丰富的类群,分为原鞘亚目(Archostemata Kolbe,1908)、藻食亚目(Myxophaga Crowson,1955)、肉食亚目(Adephaga Schellenberg,1806)和多食亚目(Polyphaga Emery,1886)。随着分子生物学的发展,分子系统学的技术被广泛应用于鞘翅目系统学研究中。本文综述了鞘翅目高级阶元的分子系统学的研究进展及存在问题。基于分子生物学手段,分子分类学家提出了关于鞘翅目高级阶元分子系统学很多假说,分子分析结果支持鞘翅目的4个亚目各为单系,而亚目间的系统关系还不统一。基于分子手段对于亚目内的系统发育关系的研究也有了一定的进展,比如:分子系统学结果支持肉食亚目的水生类群和陆生类群分别为单系,水生类群为一次起源。目前,鞘翅目高级阶元分子系统学的研究还不够成熟和完善,主要表现为:材料选择有限且不均衡、基因数目和适合度不理想,以及一些关键节点研究的欠缺。