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低氧预处理人胎盘绒毛膜间充质干细胞环状RNAs的生物信息学分析

来源 :广州医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiongll

【摘 要】

：

目的采用生物信息学方法预测低氧预处理人胎盘绒毛膜间充质干细胞环状RNAs相对应的miRNA及其靶基因,并分析靶基因所参与的生物学过程和信号通路。方法用Arraystar公司的商业

【作 者】

：

郝文革  孙逊沙  吴洁莹  陈劲松  喻秋霞  李焱  吴 

【机 构】

：

广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心,中山大学附属广州市妇女儿童医疗中心,中山大学附属第一医院

【出 处】

：

广州医药

【发表日期】

：

2019年2期

【关键词】

：

环状circRNA 低氧 间充质干细胞 生物信息学 

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(81601004,81102248);广东省自然科学基金(2016A030310139);广州市妇女儿童医疗中心儿科研究所基金(YIP-2016-014)

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目的采用生物信息学方法预测低氧预处理人胎盘绒毛膜间充质干细胞环状RNAs相对应的miRNA及其靶基因,并分析靶基因所参与的生物学过程和信号通路。方法用Arraystar公司的商业软件为环状RNAs预测其相对应的miRNAs,分别用targetScan7.1和mirdbV5数据库预测miRNAs的靶基因,并取两个预测结果的合集,应用在线网站http://www.geneontology.org和http://www.genome.ad.jp/kegg对靶基因进行功能富集分析和信号通路富集分析。结果功能富集分

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