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蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点，对揭示生命起源与进化机制有重要意义。本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白，利用结构比对信息，构建了不同层次单绕样本系统聚类图。分析发现：功能相似蛋白存在明显聚集现象，同一超家族样本基本聚在一个大支中，同一家族样本集中在所属超家族下的小支中，功能约束下单绕样本聚类图与物种进化图有较好对应关系。结果表明：单绕蛋白的结构演化反映了蛋白质功能的约束，特定功能单绕样本的结构差异具有种属特异性，结构演化包含了物种进化信息。