Pathway Tools可视化分析水稻基因表达谱

来源 :激光生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：bp0604

【摘要】

：

后基因组时代的到来使基因转录组学、蛋白质组学和代谢组学等高通量、多层次的生物研究手段广泛应用于植物科学研究,从海量数据中有效挖掘必要的生物信息成为当今组学研究的

【作者】

：

张晓婷谢荔岩林奇英吴祖建谢联辉

【机构】

：

福建农林大学植物病毒研究所,河南农业大学植物保护学院

【出处】

：

激光生物学报

【发表日期】

：

2008年3期

【关键词】

：

水稻基因表达谱代谢途径分析 RiceCyc数据库 PathwayTools rice （Oryza sativa） expression profili

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

后基因组时代的到来使基因转录组学、蛋白质组学和代谢组学等高通量、多层次的生物研究手段广泛应用于植物科学研究,从海量数据中有效挖掘必要的生物信息成为当今组学研究的瓶颈问题。RiceCyc（http：//www.gramene.org/pathway/）及其核心软件Pathway Tools是水稻代谢途径分析的有效工具。通过搜索TIGR（ht-tp：//www.tigr.org/tdb/e2k1/osal/）数据库,用Pathway Tools软件的omics viewer工具将耐盐品种FL478和其不耐盐亲

其他文献

不同超级杂交稻组合期剑叶^14C-同化物的转运及分配与早衰关系的研究

选取具有不同早衰特性的超级杂交稻组合两优培九、Y两优1号和培两优E32为供试材料，借助^14C同位素示踪技术对其不同生育期剑叶^14C同化物分配及转化进行了研究。结果表明：随着

期刊

超级杂交稻组合^14C-同化物转运分配“源、库、流”super hybrid rice combinations ^14C-assimilate

考虑衬砌变形与接头特征的盾构隧道纵向刚度

针对盾构隧道纵向刚度计算未考虑衬砌差异变形、接头特征及错缝拼装增强效应,定义考虑错缝拼装作用的横向刚度有效率,提出衬砌差异变形系数与接头等效刚度修正系数.推导盾构

期刊

盾构隧道纵向刚度理论推导数值计算

平面关节型机器人关节力矩的卡尔曼估计

为了解决常用测电流获取机器人关节力矩方法中,各种噪声干扰使所得关节力矩波动较大,影响机器人控制信息可靠性的问题,提出基于机器人动力学模型的卡尔曼滤波方法对关节力矩

期刊

平面关节型机器人动力学模型关节力矩卡尔曼估计SCARA robotdynamic modeljoint torqueKalman estimati

基于测量波阻抗的同杆双回输电线路故障识别

为提高行波保护在同杆双回输电线路上的灵敏性与可靠性,提出一种基于S变换的测量波阻抗比率制动故障识别算法.利用S变换获取母线电压与线路电流的初始行波相量,据此计算线路

期刊

同杆双回输电线路测量波阻抗变换综合和波阻抗综合差波阻抗故障识别double-circuit transmission lines on same t

同源四倍体水稻受精与胚胎形成过程的观察

激光扫描共聚焦显微术具有“组织与细胞CT”的功能，可以对整体组织进行扫描并构建三维结构。在水稻胚囊发育研究上建立的整体染色透明激光扫描共聚焦显微术辅助DIC法，对同源四

期刊

激光扫描共聚焦显微术同源四倍体水稻双受精胚胎形成confocal laser scanning microscope autotetraploid

利用农杆菌介导法将γ-生育酚甲基转移酶基因导入油菜的研究

将γ-生育酚甲基转移酶基因导入油菜，旨在提高菜油中的维生素E含量。为了使该基因在油菜种子中特异表达，采用油菜种子特异启动子BcNA1，构建了植物表达载体pBIBE。以花油五号和花

期刊

γ-生育酚甲基转移酶基因BcNAl启动子农杆菌介导法γ-TMT gene BcNA1 promoter Agrobacterium-mediated

无损光学法测量人胃粘膜／粘膜下层组织的光衰减特性

研究了人正常胃粘膜及粘膜下层组织对640 nm,690 nm,740 nm,790 nm,840 nm和890 nm波长的钛宝石激光的光衰减特性以及光学穿透深度,实验采用激光斜入射式空间分辨反射光和CCD

期刊

人胃粘膜/粘膜下层组织光衰减特性激光CCD探测器空间分辨漫反射光human stomach mucosa/submucosa tissue opt

紫色甘薯品系6种酶的同工酶分析

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，选用过氧化物酶（POD）、超氧化物歧化酶（SOD）、细胞色素氧化酶（CYT）、淀粉酶（AMY）、酯酶（EST）、苹果酸脱氢酶（MDH）等六种酶的同工酶系统对14个紫色甘薯品种（系）进

期刊

紫色甘薯同工酶聚类分析purple sweet potato isozyme cluster analysis

基于光纤式动态光散射的人血清白蛋白研究

人体尿液中血清白蛋白急剧增加会导致肾脏病发生几率增大，利用动态光散射技术（dynamic light scattering，DLS）研究人血清白蛋白有助于推动诊断肾脏病的早期发现。分析了人血清白

期刊

人血清白蛋白动态光散射单模光纤粒径测量human serum albumin gene dynamic light scattering （DLS）

外源一氧化氮对镉胁迫下绿豆幼苗根尖抗氧化酶的影响

采用水培法研究外源一氧化氮对镉（cd）胁迫下绿豆幼苗根尖抗氧化酶活性的影响。结果表明：0．01mmol／L和0．1mmol／L一氧化氮供体硝普钠（sodium nitroprusside，SNP）显著促进上胚轴生长，1mmol／L

期刊

绿豆镉一氧化氮抗氧化酶mung bean（ Phaseolus aures） cadmium （Cd） nitric oxide antiox

Pathway Tools可视化分析水稻基因表达谱

其他学术论文