沼气池启动后，加强日常管理、控制好发酵过程是提高产气率的重要技术措施。要使沼气系统长时间内产气好、产气旺，必须做好“三分建池，七分管理”。
　　1.日常管理
　　1.1日常出料 按照“先出后进，出多少、进多少”的原则，以保证有足够、稳定的贮气空间和适宜的发酵浓度。进、出料后发酵液面要始终保持在正常水位，以防止沼气因水位低于进、出料管口而溢出。若出料后不能及时进料，导致发酵液面高出进、出料管口，可暂时加水使液面达到正常水位。
　　1.2日常进料 一般农村户用沼气池每间隔5～10天进、出料1次，进、出占总有效容积5%的原料，也可按1 平方米沼气池进干料3～4 公斤的比例加入发酵原料。沼气池应尽量与厕所、圈舍连通，否则从远处运输原料费时、费力，且进料不及时，还可能造成料、水混合的不均匀而影响正常产气。
　　1.3勤搅拌 搅拌可以使沼气池细菌和发酵原料充分接触，打破池内上层浮渣结壳，使产生的沼气进入气箱。常用的搅拌方法有2种：一是通过设置在沼气池的手动回流搅拌装置，每天用活塞在回流搅拌管中上下抽动10次，将发酵间的料液抽出，再回流进进料口，进行人工强制回流液搅拌。二是通过小型电动污物泵，将出料间的料液抽出，再回流到进料口，进行电动液体搅拌。
　　1.4勤检查 要经常对沼气池检查，看是否有漏水、漏气现象。发现问题要及时处理，具体检查中要做到“三看”：一是看池口。防池盖不严实或压力过大出现漏气。水封圈内蓄水容易蒸发和渗漏，要及时补充；二是看输气管道、开关、接头是否漏气。发现漏气，要立即更换或维修；三是看压力仪表。使用沼气要安装压力检测仪表和限压装置，在日常管理中，要经常注意检查压力仪表的变化，以免压力过大，胀坏气箱。
　　1.5定期大换料 沼气池大换料应注意的问题：一是大换料前20 天停止进料；二是备足新原料并进行池外堆沤等预处理，尤其是来源于具有消毒防害措施的集中养殖场的发酵原料；三是保留30%的料液作为接种物；四是注意消除池底沉渣和其他杂物；五是避免在低温季节进行大换料，一般应在10 ℃以上气温时进行换料。
　　2.常见的问题及解决方法
　　2.1温度过低 采用自然温度进行发酵的工艺，不能安排在冬季和初春季节启动。应在向池内投料、加水封池之后，池温仍能高于15 ℃的时候进行启动。如果投料后才发现因池温低而不能正常启动，可向池内增投一些质量好的接种物、马粪、粉碎秸秆等易发热的原料，并将水加热到30℃～40 ℃后加入池内，以提高池内温度。为了保证沼气池在冬季也能产生沼气，秋季大换料启动时间一般安排在11月中旬以前完成，这样在入冬时正常的微生物体系已经基本形成，沼气池便可正常产气。
　　2.2未加接种物或接种物太少 接种物中含有大量的沼气微生物，加入接种物就是给沼气池加入产生沼气的微生物菌群，这是任何沼气发酵都不可缺少的条件。缺乏接种物，在投料时只向沼气池加入原料和水，结果导致发酵无法启动。虽向沼气池加入了接种物，但是数量太少，质量不好，致使加入沼气池的沼气微生物不足，仍不能正常启动。为了避免启动失败，在投料时必须按发酵工艺的要求，向沼气池内投入质量较好、数量足够的接种物。
　　2.3原料酸碱度失衡 当沼气池内pH值过低时，沼气微生物不能正常活动，发酵也不能启动。造成pH值过低的原因有沼气池温度较低、接种物质量差或数量少、秸秆原料没有进行堆沤处理、产酸太快、投料浓度过高等方面。料液pH值过低，表现在水压间的料液发黄，有一股特殊的酸味，液面有一层白色薄膜，表明料液pH值在6.5以下。遇到这种情况，最简单的解决方法是取出部分料液，补加一些接种物。另外，用草木灰、石灰水或氨水将pH值调到接进7.0，也有利于产气。
　　2.4发酵原料含饲料添加剂和抗生药物的成分或喷有农药 在现代养殖业中，养殖户为控制畜禽的疾病和促进畜禽的生长，使用了大量的饲料添加剂和各种抗生药物。这些成分残留在粪便中，使粪便里含有杀菌和强烈抑制甲烷菌生长繁殖的元素，致使不能产气。而有的沼气用户使用的是喷洒了农药的粪便，造成产沼气细菌中毒，停止繁殖，不能产气。为了避免此类情况发生，严禁消毒粪便入池。含有饲料添加剂成分的猪粪入池前，先进行堆沤处理，再入沼气池。