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目前,我国刑事司法领域尚未建立系统的刑事司法应急制度.为破解涉疫刑事案件激增,案多人少的矛盾突出,案件侦办面临重重困难,诉讼进程受到诸多阻碍等难题,应当在现有刑事司法理念和制度的基础上,对紧急状态下的刑事司法运行方式进行适度调适.刑事司法应急制度的生成逻辑应遵循风险与犯罪交汇互动的规律,以认罪认罚从宽制度为实践铺陈,以依法从严从重、审慎入罪、线上办案、检察机关提前介入引导办案和权利保障为理念架构.建立刑事诉讼全流程应急联动机制、司法主体应急流动机制、重大疫情刑事风险预警、刑事司法应急监督与救济机制是完善刑事司法应急制度的有效路径.