目的：研究对比阴道彩超与腹部彩超在诊断异位妊娠应用效果。方法：将2014年7月至2015年7月确诊的异位妊娠患者88例为研究对象。并在统计学原理的指导将其分为基础性资料并无差异的对照组和观察组。对照组患者经腹部彩超进行诊断，观察组患者使用阴道彩超进行诊断。对比两组患者的诊断结果。结果：对比检出率的时候发现，观察组患者检出41例，检出率为93.2％，对照组患者共检出35例，检出率为79.6％，数据符合统计学差异（P＜0.05）；且检查期间观察组患者检出的附件包块、胚芽、宫内假孕囊、心血管搏动例数与概率均高于对照组（P＜0.05）。结论：临床诊断异位妊娠的过程中，为加强临床诊断的准确性，提高诊断符合率，相对比腹部超声诊断，阴道超声诊断更具有临床应用价值，可在临床上推广应用。