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有中国特色的水稻设计育种体系是我国设计育种研究工作中最具有研究基础,也是最可实现自主知识产权的一个领域。重点介绍了国家水稻商业化分子育种技术创新联盟建设这一体系的相关工作和规划。尽管还面临着诸多问题和挑战,但只要政产学研深入融合,就能保障该体系的全面建成和推广,服务民族种业的跨越式发展。