亚洲棉全基因组中NAC类转录因子基因的鉴定与分析

来源 :石河子大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：MHSLOVE

【摘要】

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为了开发棉花NAC基因资源，本文利用生物信息学方法在亚洲棉基因组中预测了138个NAC基因，根据其在染色体上的位置关系命名为GaNAC001-GaNACl38，所有GaNAC基因分布于亚洲棉13条染

【作者】

：

赵灿刘任重柳展基李菲王立国马骏骏朱新霞

【机构】

：

石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,山东棉花研究中心

【出处】

：

石河子大学学报(自然科学版)

【发表日期】

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2015年4期

【关键词】

：

NAC转录因子棉花亚洲棉生物信息学 NAC transcription factor cotton Gossypium arboretum L bioin

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为了开发棉花NAC基因资源，本文利用生物信息学方法在亚洲棉基因组中预测了138个NAC基因，根据其在染色体上的位置关系命名为GaNAC001-GaNACl38，所有GaNAC基因分布于亚洲棉13条染色体上。根据GaNAC蛋白的序列相似性及系统进化分析，将亚洲棉GaNAC蛋白分为11个亚家族，每个亚家族的GaNAC蛋白数目为4—25个。基因结构分析发现，大部分（63．7％）GaNAC基因含有2个内含子。比较亚洲棉与陆地棉、雷蒙德氏棉NAC蛋白的同源性，发现亚洲棉与雷蒙德氏棉NAC蛋白的匹配程度高于陆地棉，平

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