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目的：对比分析某军队医院军队医改、基本医保、外地医保和自费四种不同付费方式工作量、医疗费用、病种、工作效率的差异，探讨不同付费方式对医院经济的影响，提出军队医院发展的对策建议。方法通过“军字一号”系统采集数据，利用Excel 2010和SPSS 16．0软件进行统计分析。结果某军队医院外地医保患者最多，次均费用最高；军队医改患者最少，与基本医保患者次均费用基本相当。军队医改患者平均住院日最长，药占比最低。结论不同付费方式对医院经济结构产生不同影响，应当加快军队医院支付制度改革，将军队医院纳入地方公立医院改