【摘 要】
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银杏(Ginkgo biloba L.)是雌雄异株植物,其植株价值因性别不同而异。银杏转录组数据中EST-SSR位点的生物信息学分析将为银杏遗传学研究开展提供重要的理论与方法支持。首先通
【基金项目】
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山西省高等学校大学生创新创业训练计划(编号:2019109);山西省高等学校科技创新项目(编号:2019L0369);山西农业大学博士科研启动项目(编号:2017YJ22);山西省优秀博士来晋工作奖励项目(编号:SXYBKY201742)
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银杏(Ginkgo biloba L.)是雌雄异株植物,其植株价值因性别不同而异。银杏转录组数据中EST-SSR位点的生物信息学分析将为银杏遗传学研究开展提供重要的理论与方法支持。首先通过高通量测序技术获得银杏大、小孢子叶球转录组数据,然后开展数据拼接组装与EST-SSR位点挖掘及相应的生物信息学分析。转录组数据处理及拼接组装后共获得108307条unigenes,然后利用MISA软件发掘银杏转录组数据中的SSR位点,最终从8178条unigenes中检索出9668个SSR位点。其中,单核苷酸重复的数量最
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