采用长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）高通量测序技术检测氧诱导视网膜病（oxygen-induced retinopathy，OIR）新生小鼠和正常新生小鼠视网膜组织lncRNA的差异表达情况，为早产儿视网膜病变（retinopathy of prematurity，ROP）的发病机制研究提供依据。
方法清洁级C57BL/6J新生小鼠48只，按随机化配对设计分为OIR组和对照组，每组24只。生后第7天，将OIR组小鼠与母鼠饲养于密闭有机玻璃箱内，氧浓度（75±2）%，于生后第12天恢复在空气中饲养，继续饲养5 d。对照组小鼠一直饲养于正常空气环境中，至生后第17天。生后第17天，2组小鼠处死后摘除眼球，荧光显微镜观察视网膜血管形态与分布，光学显微镜下计数突破视网膜内界膜的血管内皮细胞核数目，同时采用实时荧光定量聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）对高通量测序得到的差异表达lncRNA进行验证。基于lncRNA与mRNA表达相关性以及lncRNA与mRNA基因组位置近邻关系，得到lncRNA的潜在靶基因。同时通过GO和KEGG Pathway分析对lncRNA表达谱进行初步生物信息学分析。采用t检验及Graphpad Prism对数据进行统计分析及绘图。
结果lncRNA高通量测序技术分析获得1 118条与OIR相关的lncRNA（差异表达倍数≥2倍，P<0.05）。采用实时荧光定量PCR验证结果表明，OIR组XLOC_150632、XLOC_150636表达明显上调，XLOC_122045、XLOC_100454、XLOC_170009、XLOC_122042表达明显下调。差异表达lncRNA的靶基因经GO分析有852个靶基因富集于生物学进程，1 148个靶基因富集于细胞组件，2 100个靶基因富集于分子功能；Pathway分析36个显著富集的生物学通路，主要涉及视网膜发育、血管内皮细胞趋化、迁移及能量代谢。
结论OIR小鼠视网膜组织中lncRNA存在差异表达，其中XLOC_150632、XLOC_150636潜在靶基因成纤维细胞生长因子2与磷脂酰肌醇-3激酶通路相关，可能与OIR视网膜新生血管形成相关。