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农业科研院所在我国经济和社会发展中发挥着重要作用,建立并完善农业科研院所的内部控制系统,对内部资源的合理配置及推进农业科研工作的有序运行具有重要意义。文章针对农业科研院所的特点,从加强内部控制意识、完善内部控制体系、加深业务和财务融合、提高信息化程度等方面分析了内部控制存在的问题及对策。