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为了从DNA分子水平揭示秦川牛群体遗传多态性和群体遗传结构，寻找可用于秦川牛的微卫星标记，本研究选择了12个普通牛（Bos taurus）微卫星标记检测了90头秦川母牛各微卫星位点的遗传变异及多态性。结果表明，在秦川母牛群体中，12个微卫星位点共检测到了247个等位基因，各位点的等位基因数在13（INRA005）～33个（HEL13）之间，平均每个微卫星位点的等位基因数为21个；总有效等位基因数和平均每个位点平均有效等位基因数（Ne）分别分为142．6229和11．8852。各位点平均基因频率取样方差（V