生物信息学筛选催化茶黄素合成的多酚氧化酶

来源 :华南师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：woshi19891

【摘要】

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利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶

【作者】

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周仲华张达倪贺李海航

【机构】

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华南师范大学生命科学学院

【出处】

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华南师范大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2017年3期

【关键词】

：

多酚氧化酶茶黄素合成生物信息学同源建模分子对接

【基金项目】

：

2015年中央农业技术推广项目(粤农财2015,No.60-43);广东省科技计划项目(2014A010107026)

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利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶体结构（1BUG）为模板,构建各PPO的三维结构模型,经Procheck和Verify3D评价后,获得163个优质的PPO三维结构.用TM-score（空间拓扑）和RMSD（结构叠合）对163个PPO与茶PPO（A6N8J4）的三维结构进行了相似性比较.用Autodock Vina将163个PPO与茶中4种主要儿茶素

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