SUB1在肝癌患者中的预后价值

来源 :岭南现代临床外科 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huanghoubin101

【摘要】

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目的利用TCGA及Oncomine数据库,分析SUB1在肝癌组织中的表达水平;评价SUB1在肝癌患者中的预后价值;利用基因集富集分析(GSEA)及及基因集变异分析(GSVA)分析受SUB1影响的细胞

【作者】

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黄勇平唐德钧刘冬张环唐光华都敏杨小兰

【机构】

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深圳市龙岗区人民医院普通外科

【出处】

：

岭南现代临床外科

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

SUB1 肝癌预后 TCGA Oncomine SUB1 liver cancer Prognostic value TCGA Oncomine

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目的利用TCGA及Oncomine数据库,分析SUB1在肝癌组织中的表达水平;评价SUB1在肝癌患者中的预后价值;利用基因集富集分析(GSEA)及及基因集变异分析(GSVA)分析受SUB1影响的细胞通路。方法下载TCGA的肝癌队列RNA⁃seq数据,通过质量控制及标准化后分析其在肝癌组织及癌旁的表达变化,进一步在Oncomine数据库中进行分析验证;根据SUB1中位数表达量将TCGA数据库肝癌队列患者分为高表达及低表达两组,进行总生存(OS)分析及无复发生存(RFS)分析;GSEA及GSVA方法用于分析受

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