单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种对单个细胞进行转录组分析的新技术.过去10年,随着更灵敏、自动化且性价比更高的单细胞分离方法的出现,以及高通量技术的创新和不断改进的操作流程,scRNA-seq的灵敏度、准确性和效率都得到了提高.目前的各种方法各具特色,研究人员可以选择最合适的方法来开展自己的研究.通过分析复杂混合细胞群中的单个细胞,scRNA-seq在区分海量数据中隐藏的细胞群异质性以及发现与肿瘤发生和转移相关的稀有细胞类型方面,比传统测序法具有更大的优势.近年来关于乳腺癌的研究中,scRNA-seq将乳腺癌细胞聚类为不同的分子亚型,鉴定出了与不良预后和耐药相关的亚群.该技术鉴定出了与免疫监视相关以及可作为潜在免疫治疗靶点的免疫细胞亚群,解释了肿瘤微环境的异质性.此外,除了探索肿瘤异质性,scRNA-seq在乳腺癌研究中还有很多应用,包括分析细胞间信号传递、调节性单细胞状态、免疫细胞分布等.由于scRNA-seq能够鉴定出包含潜在治疗靶点的细胞亚群,因此可作为有应用前景的工具,促进个体化治疗.目前单细胞测序应用于乳腺癌治疗选择方面的研究相对较少,因此需要研究者的共同努力和创新,将单细胞测序技术更好的应用于乳腺癌治疗研究,为探索个体化治疗开辟道路.本综述简要介绍了目前可获得的scRNA-seq方法及其优缺点,为选择合适的研究方法提供了参考.通过综述已发表的相关研究,我们还讨论了目前scRNA-seq在乳腺癌肿瘤异质性研究、个体化治疗以及上述其他研究方向中的应用.最后,我们讨论了现有scRNA-seq技术的局限性及仍需克服的技术问题.