Y染色体单倍群SNP复合检测体系的构建及其在家系排查中的应用研究

来源 :南京医科大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:troy003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:构建Y染色体单倍群SNP复合检测体系(以下简称为“Y-SNP体系”),并评价其在法医遗传学家系排查中的应用价值.方法:筛选在东亚地区典型分布的Y染色体单倍群SNP位点,基于微测序技术构建复合体系并进行性能验证.采集4个社会学家系共20例男性血卡样本,利用Y-SNP体系与DNA TyperTM Y29试剂盒进行检测,统计分析同一家系中Y-SNP单倍群与Y-STR单倍型的差异,并利用网络图对其进行可视化.结果:筛选出74个Y-SNP位点并构建两组复合检测体系.Y-SNP体系分型准确,最小DNA检出量为0.14 ng,可用于检测血卡、口腔拭子、指甲、毛发(带毛囊)等常见检材.在非人源DNA样本中,除黑猩猩与恒河猴外,其余均未检出特异性峰型.P1家系Y-STR单倍型与Y-SNP单倍群均相同;P2家系Y-STR单倍型不同(容差≤5),Y-SNP单倍群相同;P3家系Y-STR单倍型不同(容差>5),Y-SNP单倍群不同;P4家系Y-STR单倍型不同(容差>5),Y-SNP单倍群相同.结论:Y-SNP体系与Y-STR数据联合应用可提高家系排查准确率.
其他文献
目的:应用生物信息学技术筛选高乳腺密度和低乳腺密度的正常女性的差异基因并分析其富集通路,为致密型乳腺女性乳腺癌早期诊断、靶向治疗和预后评估提供理论依据.方法:从GEO数据库获取GSE38506数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因.使用DAVID数据库进行GO、KEGG富集分析,并应用STRING及Cytoscape软件的CytoHubba插件进行蛋白相互作用网络分析,筛选出Hub基因.最后使用bcGenExMiner在线工具对这5个Hub基因进行预后分析.结果:从GSE38506基因芯片共筛选出830个
采用全球价值链位置指数和出口增值能力指数比较测度了两岸生产性服务业在全球价值链中的分工地位,并构建上游依赖度和下游依赖度指标实证评估了两岸生产性服务业之间的依赖关系.研究发现:台湾地区生产性服务业在全球价值链中的分工地位高于中国大陆.同时,中国大陆生产性服务业对台湾地区偏向于上游依赖,而台湾地区生产性服务业对中国大陆偏向于下游依赖.未来,两岸应重点加强陆路运输和管道运输业等生产性服务业合作,积极推动《海峡两岸服务贸易协议》早日实施,探索构建以大陆市场为核心的国家价值链.
目的:探索去泛素化酶YOD1在肝脏营养代谢中发挥的作用.方法:通过Q-PCR检测高脂饮食C57BL/6小鼠、db/db小鼠肝脏中以及油酸(oleic acid,OA)处理后的Hepa1-6细胞内,YOD1的表达情况.在C57BL/6小鼠中,通过Q-PCR法检测YOD1的组织分布及不同营养状态下的表达情况.对Hepa1-6细胞中给予OA处理,通过甘油三酯试剂盒检测细胞内甘油三脂含量,并利用油红染色观察细胞内脂滴.经Q-PCR和蛋白免疫印迹法检测细胞内相关基因的mRNA及蛋白水平.结果:短期高脂饮食后,肝脏中
理清影响欠发达民族地区农户内生发展的因素并因症施策对于提高其内生发展能力,进而更好促进乡村振兴与实现共同富裕具有重要意义.通过构建Probit模型与多元线性回归模型,实证分析发现,心智能力和区位环境对家庭创业行为与返贫风险具有显著影响,且这种影响因家庭背景而存在异质效应.具体而言,以好学能力、吃苦耐劳、教育水平等代表的心智能力和以市场中心、交通状况、旅游景区等代表的区位环境会影响农户创业,进一步分析发现,心智能力与区位环境等对不同收入水平农户的创业行为产生异质影响效应.在返贫风险层面,好学能力更强、更勤劳
基于家庭追踪调查数据(CFPS),运用VEP测量模型度量农村家庭的贫困脆弱性,并利用二元Logistic模型,分析贫困脆弱性的影响因素.结果表明,农户家庭陷入相对贫困的概率不断降低;农户家庭的贫困脆弱性具有地区异质性;年龄、学历、家庭规模等因素对农户家庭的贫困脆弱性具有较显著影响.基于此,提出全面构建社会保障和经济发展成果共享体系,合理分配不同省份的教育、医疗、技术等资源,坚持教育公平、巩固提高义务教育水平等对策建议,为政府部门制定相应扶贫政策提供依据,从而促进农村生活条件的进一步改善和农村经济社会的全面
开放是新时代中国发展的重要特征,对外开放能够对微观经济主体产生显著影响.借助爬虫技术归集2007-2018年上市企业年报的“数字化转型”关键词,刻画了微观主体数字化转型指标,探索对外开放对企业数字化转型的影响及其内在机理.研究发现,对外开放显著提升了企业的数字化转型水平.从影响机制看,对外开放改善了企业的财务状况,并提升了企业的创新潜能,这些都有助于企业数字化转型水平的提升.
基于1981-2018年114个发展中国家的年度非平衡面板数据,运用固定效应模型、工具变量两阶段最小二乘法(IV-2SLS)和广义矩估计法(GMM),实证检验了移民汇款对人力资本的影响.结果 表明,移民汇款对人力资本积累具有显著的促进效应,制度环境对移民汇款与人力资本的关系具有正向调节效应.进一步对中低收入国家和中高收入国家进行异质性检验发现,移民汇款对中低收入国家人力资本积累的贡献更大;就制度环境在国际移民汇款对人力资本影响中的调节效应而言,中高收入国家更显著.
Acute hypoxic-ischemic brain damage (HIBD) mainly occurs in adults as a result of perioperative cardiac arrest and asphyxia.The benefits of n-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFAs) in maintaining brain growth and development are well documented.However
目的:采用高分辨血管壁成像(high-resolution vessel wall imaging,HR-VWI)探讨大脑中动脉(middle cerebral artery,MCA)斑块特征与缺血性卒中复发的相关性.方法:回顾性分析本院105例经血管壁成像确认MCA存在斑块的患者资料,根据有无狭窄血管同侧急性缺血性卒中事件及其发生次数分为初发组(n=61)、复发组(n=19)、非症状组(n=25).采用方差分析、卡方检验、Fisher精确概率法或Kruskal-Wallis检验对比分析3组患者MCA狭窄
从并购动因和并购影响两方面分析中国企业海外并购行为,结果表明:就并购动因而言,中国企业海外并购表现出明显的市场寻求、资源寻求以及战略资产寻求特征;从并购对于目标企业的影响来看,在中国企业并购之后目标企业员工平均薪酬有所上升.进一步地,将中国企业海外并购与美国企业进行对比发现:在市场寻求和资源寻求方面,中国企业海外并购与美国企业相比不存在显著差异;在并购之后,中国企业对于目标企业多个维度的财务指标并未产生显著的不利影响;与美国企业不同的是,中国企业更注重目标企业专利而较少关注其财务表现.