玉米矮花叶病毒北京分离物复制酶基因的克隆及序列分析

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以MDMV北京分离物RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增了含复制酶(NIb)基因的DNA片段,将其克隆到pUC18载体上并进行序列分析.结果表明:NIb基因由1563个碱基组成,编码521个氨基酸并含有高度保守基序GDD.NIa/NIb和NIb/CP交界处的蛋白酶切割位点分别为Q/C和Q/S.NIb基因(北京分离物)在碱基数目上与保加利亚分离物完全一致,二者的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为70.6%和76.6%,而与SCMV-SC的核苷酸及氨基酸序列同源性则高达81.3%和92.1%.
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