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目的探讨长链非编码RNA（lncRNA）在结直肠癌（CRC）中的表达特征及其对患者生存预后判断的潜在价值。方法下载肿瘤基因图谱（TCGA）中CRC相关的RNA序列（RNA-seq）数据，进行lncRNA表达差异、功能、通路富集、调控网络及lncRNA-mRNA共表达分析，同时分析lncRNA差异表达对CRC患者预后的影响。结果对TCGA 453个CRC临床样本数据进行分析，提示有119个lncRNA存在差异性表达，lncRNA和编码基因存在共表达关系，对基因富集性分析发现，lncRNA参与细胞的多个生物学行为；16个lncRNA对患者生存预后显著相关，其中3个lncRNA BVES-AS1、HAND2-AS1和MAMDC2-AS1为关键lncRNA，可作为预后判断的标志物，同时与miRNA、coding gene存在紧密的调控网络。结论lncRNA在CRC中存在差异性表达，起着重要的调控作用，在CRC患者诊断、靶向治疗及预后判断方面具有潜在的应用价值。