【摘 要】
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目的:运用基因芯片比较前列腺癌和配对癌旁组织样本的表达谱数据,识别差异表达的SE-lncRNA并探讨其调控功能。方法:通过SBC非编码RNA芯片和公共获取数据库,筛选出差异表达的S
【机 构】
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复旦大学生命科学学院,上海生物芯片有限公司
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目的:运用基因芯片比较前列腺癌和配对癌旁组织样本的表达谱数据,识别差异表达的SE-lncRNA并探讨其调控功能。方法:通过SBC非编码RNA芯片和公共获取数据库,筛选出差异表达的SE-lncRNA和mRNA,利用GSEA/GO富集分析其功能,并对差异表达基因构建共表达网络。结果:在芯片中共鉴定到292个在前列腺癌中差异表达的SE-lncRNA,挑选5个基因用qRT-PCR验证,检测结果和芯片一致。通过对超级增强子及其靶基因启动子进行转录因子预测分析,构建了一个SE-lncRNA-转录因子-靶基因三元调控网
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