胃癌淋巴结转移相关长链非编码RNA的鉴定及验证

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目的

对胃癌淋巴结转移相关长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)进行筛选和验证。

方法

应用Agilent Array平台对3例胃癌阳性淋巴结和1例正常淋巴结行lncRNA芯片,聚类分析lncRNA和mRNA表达水平检测,筛选胃癌转移淋巴结中异常表达的lncRNA。随机选取15个高表达和15个低表达的lncRNAs,应用RT-PCR验证这些lncRNAs的表达水平。

结果

与正常淋巴结相比,将胃癌转移淋巴结中表达变化6倍以上者确定为差异表达者,其中353个lncRNAs表达上调和464个lncRNAs下调,547个mRNAs上调和562个mRNAs下调。RT-PCR实验结果显示:与正常淋巴结相比,lncRNA OR3A4、LOC84740、FCGR1C和C21orf 96在胃癌阳性淋巴结中表达上调,lncRNA MSTO2P、LOC344595、TUG1,TYW3和KRT8P10在胃癌阳性淋巴结中表达下调。

结论

lncRNAs在胃癌淋巴结转移中存在异常表达。

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