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以广陆矮4号为受体，日本晴为供体的119个染色体单片段代换系为材料，通过单因素方差分析和Dun-nett’s多重比较，分析染色体单片段代换系与受体亲本之间糙米率的差异，对代换片段上的糙米率相关QTL进行鉴定。以P≤0．001为阈值共检测到2个糙米率QTL，利用代换作图法将其分别定位在第6染色体和第9染色体上，2个QTL均表现为增效作用，增效位点来自于粳稻亲本日本晴，其加性效应值分别为1．49％和1．32％，加性效应百分率分别为1．89％和1．68％。该研究对进一步发掘和利用新的水稻糙米率QTL具有重要意义