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阿拉善荒漠区分布有种子植物73科，328属，820种，优势现象明显，优势科8个：菊科、禾本科、豆科、藜科、毛莨科、蔷薇科、十字花科和莎草科；表征科8个：香蒲科、麻黄科、柽柳科、蒺藜科、胡颓子科、藜科、眼子菜科和蓼科。植物区系成分多样，其中，以世界广布成分为主，共35科，占总科数的47．95％，它们对当地的生态环境具有重要的决定地位；其次为温带分布，共27科，占总科数的36．97％；热带成分、热带亚热带成分和泛热带成分较少，共11科，占总科数的15．07％。这些均反映出植物的分布与气候相适应的特点。