【摘 要】
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目的:从分子水平探索弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的发病机制,筛选潜在的可用于DLBCL的诊断、治疗或患者预后判断的分子靶标.方法:使用GEO公共数据库以“弥漫大B细胞淋巴瘤”为
【机 构】
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南通市肿瘤医院肿瘤内科,江苏南通226361南通市肿瘤医院病理科,江苏南通226361;
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目的:从分子水平探索弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的发病机制,筛选潜在的可用于DLBCL的诊断、治疗或患者预后判断的分子靶标.方法:使用GEO公共数据库以“弥漫大B细胞淋巴瘤”为关键词进行检索,筛选出有正常对照的数据集,下载后使用R语言进行芯片质量控制,使用“limma”包进行差异表达分析.对于差异表达基因中的显著上调基因,使用DAVID数据库进行GO功能分析和KEGG信号通路分析,使用GEPIA数据库进行预后相关分析.结果:检索到的GSE56315中包含55例DLBCL患者活检标本和33例正常扁桃体组织B细胞的基因表达谱数据.差异分析得到2 001个差异表达基因,包括1 079个显著上调基因,922个显著下调基因.上调基因涉及425个GO条目,其中FDR＜0.05的31个,涉及17条信号通路.生存分析发现了12个上调基因的表达水平与总体生存率显著相关.结论:通过对弥漫大B细胞淋巴瘤基因表达谱数据的深入挖掘和分析,为进一步研究该病的分子机制,寻找治疗靶点和预后指标提供了重要依据.
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