基于宏基因组学的成年和老年袋鼠肠道菌群多样性和差异性研究

来源 :中国兽医杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：VANDY115

【摘要】

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为了了解袋鼠粪便中菌群的多样性,分析成年和老年袋鼠粪便中菌群的差异性.应用高通量测序技术测定成年和老年袋鼠粪便细菌16S rDNA的V3-V4变异区序列,应用Prinseq和Mothur等

【作者】

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高云航徐佳萍赵晗旭邸海洋王巍娄玉杰马红霞

【机构】

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吉林农业大学动物科技学院,中国农业科学院特产研究所,长春动植物公园

【出处】

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中国兽医杂志

【发表日期】

：

2016年1期

【关键词】

：

袋鼠肠道菌群宏基因组学 kangaroo intestinal flora metagenomics

【基金项目】

：

国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-38）：国家自然科学基金项目（31372331）,吉林省教育厅科学技术研究项目（201358）,吉林省青年科研基金项目（20130522092JH）

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为了了解袋鼠粪便中菌群的多样性,分析成年和老年袋鼠粪便中菌群的差异性.应用高通量测序技术测定成年和老年袋鼠粪便细菌16S rDNA的V3-V4变异区序列,应用Prinseq和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元（OTUs）数量,分析菌群物种丰度、分布和Alpha多样性.获得成年袋鼠粪便（AK）的OTU数为7 210,老年袋鼠粪便（OK）的OTU数为6 120.AK和OK的丰富度指数分别为4 377.028/7301.574和1 430.718/1858.623,香农指数分别为6.275和

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