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以淡水微型生态系统作为主要研究对象,针对自然和人工水体中构成微型生物群落的主要组分,细菌 - 原生动物 - 藻类,开展了有关物种、遗传和种群多样性及其结构特征的研究,重点探讨了水生微型生物群落结构的特征、生态学意义和作用机制.筛选出若干具有重要科学价值和生态学功能的模式物种、功能物种以及指示生物,深入研究了这些重要物种的生物学特性、生态学功能,以及特定作用机制.对环境监测、污水处理技术、废物资源化,以及细胞调控的分子机制等相关的科学问题提出了新的方法和理论.