羊草microRNA和靶基因的生物信息学预测

来源 :中国草地学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ww830625

【摘要】

：

为鉴定羊草microRNA基因信息并明确其在羊草生长发育、抗逆过程中的调控作用,用羊草small RNA的SRA数据,根据miRBase21.0信息比对,分别获得隶属于39个microRNA家族的141个已

【作者】

：

董园园王法微王南李晓薇李海燕

【机构】

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吉林农业大学生物反应器与药物开发工程研究中心,吉林农业大学生命科学学院

【出处】

：

中国草地学报

【发表日期】

：

2015年5期

【关键词】

：

微小RNA 羊草靶基因生物信息学分析颈环结构 MicroRNA Leymus chinensis Target gene Bioinformatics a

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为鉴定羊草microRNA基因信息并明确其在羊草生长发育、抗逆过程中的调控作用,用羊草small RNA的SRA数据,根据miRBase21.0信息比对,分别获得隶属于39个microRNA家族的141个已知microRNA基因及新注释的6个novel microRNA,并且预测到新microRNA的二级结构为颈环结构。利用单子叶植物ESTs文库预测到1196个靶基因信息,对羊草microRNA基因具有调控作用。Nr注释及COG注释显示多数靶基因参与羊草的信号转导过程,揭示microRNA参与了羊草的生长

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