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目的
分析江苏省乙型流感病毒神经氨酸酶(NA)蛋白特征性氨基酸位点的变化,掌握江苏省乙型流感病毒NA分子进化特征。
方法选择2010—2012年40株乙型流感毒株,两步法扩增NA基因片段,3730XL测序仪进行测序;利用DNAStar、Bioedit、MEGA5.0和BEAST 1.8.0等软件分析NA基因进化特征。
结果从NA进化树可以看出,28株Victoria系的分离株NA来源于Yamagata系,发生了基因的重配;部分分离毒株在462位增加了一个糖基化位点;重要的酶活性位点及耐药位点氨基酸未发生变化;2010—2012年江苏省乙型流感病毒NA基因核苷酸平均碱基替代率每年为1.74×10-3[95%HPD(最高后验密度区间): 1.46×10-3~2.06×10-3]替换/位点;整体选择压力ω(ω=dN/dS)值为0.24。
结论2010—2012年江苏省乙型流感病毒NA重要的氨基酸位点相对保守,基因速率缓慢,尚未受到明显的正向选择压力。