【摘 要】
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目的采用基因集富集分析(GSEA)方法寻找胃癌抵抗顺铂的免疫标记基因(ISGs)。方法用GEO数据库的GSE94714数据集,GEO2R分析差异基因,观察条件筛选对基因数的作用,GSEA纳入耐药
【机 构】
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安徽医科大学第一附属医院普外科胃肠外科
【基金项目】
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国家自然科学基金(编号:81874063)
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目的采用基因集富集分析(GSEA)方法寻找胃癌抵抗顺铂的免疫标记基因(ISGs)。方法用GEO数据库的GSE94714数据集,GEO2R分析差异基因,观察条件筛选对基因数的作用,GSEA纳入耐药、未耐药组胃癌细胞的全部差异表达基因,与分子标签数据库比较,获取ISGs,交集筛选,Kaplan Meier Plotter分析交集基因对胃癌预后的影响。结果差异表达基因共34183个,其中上调12452个、下调17381个,筛选差异倍数的增加使排除基因数增加。GSEA富集到标准化富集评分(NES)排序前6的条目(
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