目的:探讨呼吸道合胞病毒与肺炎支原体联合检测对儿童呼吸道病原菌筛查的应用价值。方法:2015年5月-2018年5月收治急性呼吸道感染患儿500例,联合检测呼吸道合胞病毒与肺炎支原体,观察呼吸道合胞病毒与肺炎支原体在不同呼吸道疾病以及不同年龄段的感染情况。结果:呼吸道合胞病毒与肺炎支原体联合检测总感染率为31.80%。呼吸道合胞病毒和肺炎支原体感染率在常见呼吸道疾病中的感染率差异有统计学意义(P<0.05)。在不同年龄段,1～5岁患儿感染率最高,且呼吸道合胞病毒和肺炎支原体感染率在各年龄段差异有统计学意义(P<0.05)。结论:在儿童呼吸道病原菌筛查中应用呼吸道合胞病毒与肺炎支原体联合检测,准确性较高,且快速,有利于指导医生给予针对性治疗,具有较高的临床应用价值。