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InsPecT软件能通过盲搜索对蛋白质翻译后修饰进行鉴定，但其计算时间和复杂度较高。针对该问题分别采用对等模式和主从模式实现2种并行优化方案。比较结果表明，以主从模式并行的InsPecT软件通过动态数据分配和主从处理器间的及时响应，维持了更优的负载平衡，其加速效果较明显。
InsPecT的2种并行优化方案
【摘 要】
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InsPecT软件能通过盲搜索对蛋白质翻译后修饰进行鉴定，但其计算时间和复杂度较高。针对该问题分别采用对等模式和主从模式实现2种并行优化方案。比较结果表明，以主从模式并行的
【机 构】
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中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心
【出 处】
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计算机工程
【发表日期】
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2010年6期
【基金项目】
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基金项目：国家“863”计划基金资助项目“面向科学研究的超级计算服务环境”（2006AA01A116）,国家自然科学基金资助项目“当代并行机的并行算法应用基础研究”（60533020）,国家自然科学基金资助项目“特征信息发现的并行算法及实现研究”（60673064）,中国科学院知识创新工程基金资助重大项目“面向蛋白质科学的高性能计算研究”（KGGX1-YW-13）
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