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应用生态学与生态经济学是自然科学和社会科学两大科学门类中联系最为紧密的两门学科。既有人把生态经济学列为应用生态学的分支学科,也有人认为生态经济学是经济学与生态学的融合。应用生态学将人类活动的影响纳入研究范围,生态经济学将地球自然生态系统的作用纳入研究范围,两者殊途同归,共同指向谐调人与地球生物圈关系的目标。应用生态学和生态经济学在研究内容上有很大重合性和互补性。应用生态学应借鉴经济学成果,生态经济学更应掌握生态学原理,才能进行正确的经济分析。