烤烟SNARE蛋白基因T-NTGP2全长cDNA克隆与生物信息学分析

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：howard2000_0

【摘要】

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从烤烟品种南江3号（Nicotiana tobacumcv.Nanjiang-3）均一化cDNA文库中克隆获得一个SNARE蛋白同源性较高的cDNA全长序列,命名为T-NTGP2,GenBank中的登录号为HO663897。利用ORF

【作者】

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胡重怡蔡刘体

【机构】

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贵州烟草科学研究所

【出处】

：

生物技术通报

【发表日期】

：

2011年7期

【关键词】

：

烤烟 SNARE 克隆生物信息学分析 Flue-cured tobacco SNARE Clone Bioinformatics

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从烤烟品种南江3号（Nicotiana tobacumcv.Nanjiang-3）均一化cDNA文库中克隆获得一个SNARE蛋白同源性较高的cDNA全长序列,命名为T-NTGP2,GenBank中的登录号为HO663897。利用ORF finder和ProtParam软件分析显示,它包含一个长度为597 bp的完整开放读码框,编码一个含有199个氨基酸、等电点为6.96、分子量为22.59 kD的蛋白。Blast搜索结果及进化分析结果表明,烤烟T-NTGP2基因编码的蛋白与烤烟、杨树和蓖麻的Ykt6蛋白具

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