【摘 要】
:
利用MISA软件筛选刺梨(Rosa roxburghii Tratt)转录组测序获得的106 590条Unigene,共检测出21 711个SSR位点,分布于18 155条Unigene中,出现频率为20.37%,平均分布距离为1.68
【机 构】
:
贵州大学农学院,贵州省果树工程技术研究中心,
论文部分内容阅读
利用MISA软件筛选刺梨(Rosa roxburghii Tratt)转录组测序获得的106 590条Unigene,共检测出21 711个SSR位点,分布于18 155条Unigene中,出现频率为20.37%,平均分布距离为1.68 kb。优势重复基序为三核苷酸、四核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR位点的26.87%、26.77%和24.93%。AG/CT与AAG/CTT分别是二核苷酸与三核苷酸的优势重复基元,分别占总SSR重复类型的17.80%和11.55%。以不同主导重复基元类型设计合成42对SSR引物,并以刺梨及其他蔷薇属种质的基因组DNA为模板对其有效性及通用性进行初步验证,筛选出具有清晰扩增产物的引物23对,并且均在同属材料中通用。选取16份贵州刺梨资源对筛选出的引物进行多态性检测,获得12对具有多态性的引物。以上结果表明,刺梨转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源,获得的大批量SSR标记可为刺梨及其近缘种的遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富可靠的标记选择。
其他文献
随着我国改革开放的深入和社会经济发展的需要,国家对高速公路建设的投资规模越来越大,同时也暴露出我国高速公路建设监理工作中存在的很多问题。精细化管理理念作为社会分工
利用Android系统平台的开放性及校园网络服务的高速性,设计并实现了一个基于Android操作系统移动终端的高校校园服务系统软件,该系统有效解决了当前高校智能化、信息化建设环
自20世纪30年代凯恩斯主义经济学(Keynesian)诞生以来,财政政策一直被认为是政府干预宏观经济,实现对经济进行需求管理及直接宏观调控的主要工具。不过,长期以来,西方各经济
随着我国综合国力的提高和国家对高等教育的重视,高校建设工程规模不断扩大,项目不断增加。如何抓好高校工程建设管理工作,使有限的工程建设投资发挥更好的经济效益,成了高校
职高幼师生的职业能力构成是培养幼师生职业能力的前提。培养幼师生的职业能力应包括"职业情意、认知能力、教学活动能力、艺术表现能力和社会综合能力"等方面。建立相应的课
在全球人口逐渐老龄化的趋势下,以及金融风暴的影响下,世界各国社保基金、养老基金等主管机构已感受到负债缺口压力逐渐加大。因此纷纷开始重新检视基金状况,评估退休基金是
目的:探讨快速、有效的细胞融合条件.方法:用鸡红细胞为材料,聚乙二醇(Mw=4000)为诱导剂,诱导鸡红细胞融合.结果:鸡红细胞融合的最适温度为39℃,最适时间为15min.结论:在该条件下,
在乌利希(Uhlig,2005)提出的符号约束方法的基础上,通过施加正交约束,过滤掉货币供给冲击、宽松货币政策冲击、“国家队”救市冲击对降准、降息冲击的干扰,可以较全面地探讨降
目的探讨变应性鼻炎患者的吸入变应原,谱及标准化变应原脱敏治疗的效果。方法选用阿罗格吸入性过敏原14类57种对290例变应性鼻炎患者进行皮肤点刺试验,选择相应敏感的典型过
车前始载于《神农本草经》,被列为上品,车前在《神农本草经》是以种子入药。《名医别录》中记载并用叶及根入药。《本草经集注》云:“人家路边甚多。”《本草图经》云:“今江湖