膀胱癌circRNAs介导的ceRNA网络及预后评估模型的构建

来源 :山东大学学报：医学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：aigufeixi

【摘要】

：

目的探究膀胱癌中差异性表达的环状RNAs(circRNAs),并构建circRNAs介导的ceRNA网络及预后评估模型。方法下载并分析基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)中膀胱癌RNA测序数据,以|log2 fold change(log2FC)|>1、P-value<0.05为纳入标准,筛选RNA差异表达谱。整合TCGA膀胱癌RNA差异分析数据及CircInteractome等公共数据库数据,构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,通过GEO与TCGA对网络

【作者】

：

米琦史爽李娟李培龙杜鲁涛王传新

【机构】

：

山东大学第二医院检验医学中心

【出处】

：

山东大学学报：医学版

【发表日期】

：

2021年6期

【关键词】

：

膀胱癌 circRNAs ceRNA 预后 Cox风险评估模型

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81873977,82072368),山东省重点研发计划(2019GSF108091),国家重点研发计划(2018YFC0114700)。

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