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[目的]对全国各级疾病预防控制(简称“疾控”)机构的筹资和财政投入情况进行分析,剖析问题,提出政策建议.[方法]采用问卷调查法收集全国各级疾控机构收支及结构等指标,并进行分析.[结果]2014—2018年,全国卫生总费用中用于公共卫生机构的占比从7.0％下降至5.6％;疾控机构日常运行所需的公用支出,其财政补偿水平不足50％.取消三项行政性事业收费后,部分疾控机构收支缺口未予以及时弥补,基本和重大公共卫生服务经费保障机制仍未理顺.[结论]应优化健康筹资结构,加大对疾病预防的资源投入,提高疾控机构的财政保障水平,健全公共卫生服务经费保障机制,完善多渠道筹资机制.