【摘 要】
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【目的】监测当前湖南省猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV2）流行毒株及其衣壳蛋白（capsid protein, Cap）变异情况，并预测Cap蛋白细胞毒性T淋巴细胞（cytotoxic T lymphocyte, CTL）表位，为新型PCV2疫苗研制和病毒净化提供参考依据。【方法】本研究对2019-2021年于湖南省6个地区收集的17份PCV2阳性组织样品
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（32172844）； 湖南省技术攻关“揭榜挂帅”项目（2021NK1030）； 湖南省自然科学基金项目（2022JJ40183）； 长沙市自然科学基金项目（kq2202231）；
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【目的】监测当前湖南省猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV2）流行毒株及其衣壳蛋白（capsid protein, Cap）变异情况，并预测Cap蛋白细胞毒性T淋巴细胞（cytotoxic T lymphocyte, CTL）表位，为新型PCV2疫苗研制和病毒净化提供参考依据。【方法】本研究对2019-2021年于湖南省6个地区收集的17份PCV2阳性组织样品进行PCV2全基因组序列扩增及测序分析，绘制系统进化树，利用生物信息学方法分析Cap蛋白氨基酸变异情况，并预测CTL表位。【结果】系统进化树显示，获得的17株PCV2全基因组序列中，1株PCV2a、7株PCV2b和9株PCV2d。Cap蛋白氨基酸序列比对分析发现，共有16个氨基酸残基突变位点位于病毒Cap蛋白表面，且有11个突变位点参与构象型表位的形成。此外，共预测出9个PCV2 Cap蛋白潜在的CTL表位，其中4个表位（16-24、28-36、136-144和179-187位氨基酸）在GenBank的1 610株PCV2不同基因型毒株中高度保守。通过TCR-pMHC复合物3D结构对4个保守性表位进一步分析，结果显示，这4个肽段均能与MHCⅠ分子和TCR形成稳定的TCR-pMHC复合物。【结论】本研究结果表明，PCV2b和PCV2d为当前湖南省主要流行的基因型，且表现出高度变异；预测的CTL表位可作为候选抗原表位。
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