目的研究聊城地区肠道病毒EV71的基因特征,为HFMD的预防控制提供病原学资料。方法检测标本肠道病毒EV71,用人横纹肌瘤(RD)细胞对阳性标本进行病毒分离,对分离到的EV71病毒分离株进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar 5.01和Mega 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树。结果 2010年-2013年聊城市累计报告手足口病30 947例,每年3月-7月发病较多,≤3岁患儿阳性率最高,占全部阳性患儿的90.92%。2010年-2013年聊城辖区内共送检手足口标本862份,分离到EV71阳性毒株160株,对毒株进行基因序列分析显示,2010年-2013年聊城市流行的EV71病毒株为C4a亚型群,16株EV71毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为92.8%~99.9%和97.8%~100.0%,与近缘的C4a型代表株相比,聊城优势株的氨基酸变异一般发生在VP1第98位(E→K)、145位(E→G)。结论聊城市分离株EV71是我国的优势基因型C4a,存在不同的传播链,流行的EV71相对保守,但已出现一定程度的变异。